师资队伍

  • 两院院士
  • 高层次人才
  • 在职教师
  • 荣休教师

刘艺斌

办公地点:化南230

联系电话:

电子邮箱:liuyibin@whu.edu.cn

团队主页:

个人简介

刘艺斌,73882必赢游戏欢迎光临教授、博士生导师。2010年和2015年于北京大学化学与分子工程学院分别获得学士和博士学位,导师为赵美萍教授。2015年在哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究,在COLD-PCR技术发明人Mike Makrigiorgos教授指导下开发出富集检测癌症相关的低丰度DNA突变以及异常甲基化的方法。2017年至2020年在牛津大学Nuffield医学院Ludwig癌症研究所宋春啸课题组担任博士后研究员,开发出新的单碱基分辨率、非重亚硫酸盐的DNA甲基化测序方法TAPS,用于临床肿瘤样本及血浆游离DNA的全基因组甲基化和羟甲基化修饰的分析。作为共同创始人在牛津大学科研转化平台上创建了癌症早筛公司Base Genomics,被行业领军企业Exact Sciences收购。共发表学术论文16余篇,被引用430余次。其中第一作者论文发表在Nature biotechnology、Nucleic acids research、Nature communications、 Genome biology等国际知名期刊。入选国家海外高层次人才引进青年项目以及73882必赢游戏欢迎光临泰康生命医学中心PI,2022 年10 月入职73882必赢游戏欢迎光临。本课题组长期招收博士后、博士生及硕士生,欢迎感兴趣的同学加入。


教育经历

2006.9-2010.7   北京大学化学与分子工程学院 学士

2010.9-2015.6   北京大学化学与分子工程学院 博士


工作经历

2015.6-2016.8     哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所 博士后

2016.8-2017.7     Genefirst Ltd UK 高级科学家

2017.7-2020.3     牛津大学Nuffield医学院Ludwig癌症研究所 博士后

2020.3-2020.10    Base Genomics Ltd 共同创始人

2020.10-2022.8    Exact Sciences Associate director

2022.10-至今       73882必赢游戏欢迎光临 教授    泰康生命医学中心PI


研究方向

DNA甲基化作为表观遗传学的重要现象之一,在胚胎发育等生命过程中起着重要的调控作用,并且与癌症等多种疾病密切相关。传统的亚硫酸氢钠测序法(BS-Seq)是目前DNA甲基化检测的金标准,然而其缺点也十分突出,比如剧烈的反应条件损伤DNA、转化后序列的复杂性差降低覆盖率。我的研究兴趣是采用化学和生物化学的方法开发针对DNA甲基化分析的新技术,应用于以癌症早筛为主的相关生物医学研究领域。例如TET酶氧化辅助的吡啶硼烷测序法(TAPS),在测序起始量、测序成本和测序数据质量等方面都具有明显优势,有望替代BS-Seq成为DNA甲基化检测新的金标准,目前已经实现了商业转化。研究方向包括:

(1) 单细胞多组学方法用于癌症基础医学研究

(2) 基于异常DNA甲基化和羟甲基化检测的癌症早期诊断技术的开发

(3) 新型测序平台(例如第三代单分子长读长测序)在癌症诊断方面的应用


代表成果

(1) Yibin Liu, Paulina Siejka-Zielińska, Gergana Velikova, Ying Bi, Fang Yuan, Marketa Tomkova, Chunsen Bai, Lei Chen, Benjamin Schuster-Böckler, Chun-Xiao Song. Bisulfite-free direct detection of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at base resolution. Nature biotechnology, 2019, 37, 424-429

(2) Yibin Liu, Chen Song, Ioannis Ladas, Mariana Fitarelli-Kiehl, G Mike Makrigiorgos. Methylation-sensitive enrichment of minor DNA alleles using a double-strand DNA-specific nuclease. Nucleic acids research, 2017, 45, e39

(3) Yibin Liu, Zhiyuan Hu, Jingfei Cheng, Paulina Siejka-Zielińska, Jinfeng Chen, Masato Inoue, Ahmed Ashour Ahmed, Chun-Xiao Song. Subtraction-free and bisulfite-free specific sequencing of 5-methylcytosine and its oxidized derivatives at base resolution. Nature communications, 2021, 12, 618

(4) Yibin Liu, Jingfei Cheng, Paulina Siejka-Zielińska, Carika Weldon, Hannah Roberts, Maria Lopopolo, Andrea Magri, Valentina D’Arienzo, James M Harris, Jane A McKeating, Chun-Xiao Song. Accurate targeted long-read DNA methylation and hydroxymethylation sequencing with TAPS. Genome biology, 2020, 21, 54

(5) Yibin Liu, Junqiu Zhai, Shan Huang, Simin Fang, Meiping Zhao. Construction of Antibody-like Nanoparticles for Selective Protein Sequestration in Living Cells. Construction of antibody-like nanoparticles for selective protein sequestration in living cells. Nanoscale, 2015, 7, 7162-7167


版权所有 © 73882必赢(China)欢迎光临最新官网-Mobile Application     地址:中国武汉珞珈山    邮编:430072   电话:027-68754067    邮箱: hxydzb@whu.edu.cn